為適應新形勢下高新技術企業(yè)發(fā)展，10月23日科技部、財政部、國家稅務總局聯(lián)合發(fā)布《高新技術企業(yè)認定管理辦法征求意見稿》，于正式實施。新版高新技術企業(yè)認定管理辦法與2008版管理辦法相比較，組織實施方式、專家評審、審查認定程序與現(xiàn)行高企認定程序更為匹配，認定條件、申報材料、稅收優(yōu)惠更具指向性，涉及多方面變化。具體變化如下：
一、認定條件
1.新辦法要求“企業(yè)申請認定時須工商注冊滿一年以上”。
區(qū)別：新辦法與2008版管理辦法相比明確了企業(yè)工商注冊滿一年以上是以高企申請認定時為節(jié)點。
2.新辦法要求“企業(yè)通過自主研發(fā)、受讓、受贈、并購等方式，獲得對其主要產(chǎn)品(服務)在技術上發(fā)揮核心支持作用的知識產(chǎn)權”。
區(qū)別：新辦法規(guī)定的知識產(chǎn)權不包含“通過5年以上獨占許可方式”獲得的知識產(chǎn)權，新辦法已不認可通過獨占許可的方式獲專利為企業(yè)自主知識產(chǎn)權。同時，新辦法取消了對知識產(chǎn)權“近三年”的限制。
3.新辦法要求“企業(yè)從事研發(fā)和相關技術創(chuàng)新活動的科技人員占企業(yè)當年職工總數(shù)的比例不低于10%”。
區(qū)別：與2008版管理辦法相比，新辦法無研發(fā)人員占比要求，對科技人員的占比由2008版管理辦法的“不低于30%”降為“不低于10%”，取消了學歷要求，對科技人員的定義具體還要依據(jù)新版《高新技術企業(yè)認定管理工作指引》要求。
4.新辦法要求“企業(yè)近三個會計年度的研究開發(fā)費用總額占同期銷售收入總的比例符合如下要求：①最近一年銷售收入小于2億元(含)的企業(yè)，比例不低于4%;②最近一年銷售收入在2億元以上的企業(yè)，比例不低于3%。”
區(qū)別：與2008版管理辦法相比，新辦法對研究開發(fā)費用占比做了較大調(diào)整，最近一年銷售收入小于5000萬的企業(yè)，研發(fā)費用占比由6%降為4%。
5.新辦法要求“企業(yè)創(chuàng)新能力評價應達到相應要求”。
區(qū)別：新辦法由原有的4個明確打分項變?yōu)椤皠?chuàng)新能力評價”，具體評價辦法還要依據(jù)新版《高新技術企業(yè)認定管理工作指引》要求。
二 、申請材料
1.新辦法規(guī)定提供“證明企業(yè)依法成立的相關注冊登記證件”。
變化：2015年10月1日起，營業(yè)執(zhí)照、組織機構代碼證和稅務登記證三證合一，新高企認定管理辦法不再明確要求提供具體證件，未發(fā)生實質性變化。
2.新辦法規(guī)定提供“企業(yè)高新技術產(chǎn)品(服務)的關鍵技術和技術指標，生產(chǎn)批文、認證認可和相關資質證書、產(chǎn)品質量檢驗報告等相關材料�！�
變化：本條規(guī)定是由原辦法中申請材料的第三條引申而來，更加明確了以上證明材料的指向性。
3. 新辦法規(guī)定提供“經(jīng)具有資質的中介機構出具的企業(yè)近三個會計年度研究開發(fā)費用和近一個會計年度高新技術產(chǎn)品(服務)收入專項審計或鑒證報告”。
變化：本條款新增了專項鑒證報告，鑒證報告由稅務師事務所出具，新辦法可能會將稅務師事務所納入中介機構范圍內(nèi)。
4.新辦法規(guī)定提供“經(jīng)具有資質的中介機構鑒證的企業(yè)近三個會計年度的財務會計報告(包括會計報表、會計報表附注和財務情況說明書)�！�
變化：與2008版管理辦法相比，新辦法要求提供財務會計報告，根據(jù)審計要求，會計報告含：資產(chǎn)負債表、利潤表、現(xiàn)金流量表、所有者權益變動表、會計報表附注，即“四表一注”，比原辦法“三表”更全面。另外，新辦法還新增加了“財務情況說明書”。
5.新辦法規(guī)定提供“近三個會計年度企業(yè)所得稅年度納稅申報表�！�
變化：本條款為新加條款。 11 月 3 日，國家稅務總局發(fā)布 2014 年第 63 號公告，發(fā)布《中華人民共和國企業(yè)所得稅年度納稅申報表(A 類，2014 年版)》。自2014 年企業(yè)所得稅匯算清繳工作將啟用該套申報表。其中，與高新技術企業(yè)相關的報表包括：“企業(yè)基本信息情況表”、“期間費用明細表”和“高新技術企業(yè)優(yōu)惠情況及明細表”。
三 、復審程序
新辦法與2008版管理辦法相比，去掉了原辦法第十二條、十三條中復審相關規(guī)定。
四 、年度監(jiān)理
新辦法與2008版管理辦法相比，要求“企業(yè)獲得高新技術企業(yè)資格后，應每年4月底前在‘高新技術企業(yè)認定管理工作網(wǎng)’填報上一年度知識產(chǎn)權、科技人員、研發(fā)費用、經(jīng)營收入等年度發(fā)展情況表”。新辦法加強了過程監(jiān)督管理，對累計兩年未填報年度發(fā)展情況表的企業(yè)，認定機構取消其高新技術企業(yè)資格。
五 、稅收優(yōu)惠
新辦法與2008版管理辦法相比明確了稅收優(yōu)惠時間起點，是從高新技術企業(yè)證書頒發(fā)之日所在年度起享受稅收優(yōu)惠。另外，新辦法對因為各種原因取消高新技術企業(yè)資格的企業(yè)，按《稅收征管法》及有關規(guī)定，追繳其自發(fā)生上述行為之日所屬年度起已享受的高新技術企業(yè)稅收優(yōu)惠。
除此之外，新版管理辦法在財務方面還有多處變化，具體變化及解讀如下：
(一)降低研發(fā)費用的比例要求
新辦法修改認定條件中研發(fā)投入的比例，要求“企業(yè)近三個會計年度(實際經(jīng)營期不滿三年的按實際經(jīng)營時間計算)的研究開發(fā)費用總額占同期銷售收入總的比例符合如下要求：①最近一年銷售收入小于2億元(含)的企業(yè)，比例不低于4%;②最近一年銷售收入在2億元以上的企業(yè)，比例不低于3%�！�
解讀：新辦法將“三檔”降為“兩檔”，只以2億元作為分界線，小于2億元(含)為4%，2億元以上為3%，將2億元以下的統(tǒng)一為4%，取消6%的比例規(guī)定，此認定條件的修改，意在鼓勵中小企業(yè)科技創(chuàng)新和發(fā)展，間接降低了認定標準，對于一些成立時間不長、規(guī)模較小、研發(fā)投入有限的企業(yè)來說，無疑是一個好消息。
(二)申請材料中明確“近三個會計年度的審計報告”中需要提供的資料
新辦法規(guī)定提供“經(jīng)具有資質的中介機構鑒證的企業(yè)近三個會計年度的財務會計報告”中要包括會計報表、會計報表附注和財務情況說明書。根據(jù)審計要求，會計報告含：資產(chǎn)負債表、利潤表、現(xiàn)金流量表、所有者權益變動表、會計報表附注，即“四表一注”。同時，新辦法新增“財務情況說明書”。
解讀：新辦法要求提供“四表一注”，比原辦法“三表”更全面。新增“財務情況說明書”，使得專家在評審環(huán)節(jié)對企業(yè)的經(jīng)營成果和財務狀況有更深入的了解。
